Geboren wurde der Stürmer Rustem Kalimullin 1984 in der Republik Tatarstan, wo er bei KamAZ Naberezhnye Chelny die ersten Jahre seiner Fußballerkarriere bestritt. Bis 2007 spielte er dort größtenteils für KamAZ in der russischen zweiten Liga, bis er zu Spartak Nalchik in das russische Oberhaus wechselte.

Nach zwei Jahren und 41 Einsätze für Nalchik zog es Kalimullin 2009 zu Kuban Krasnodar. Dort gelang ihm der Aufstieg 2010 aus der First Division in die Premier Liga; seine acht Ligatreffer trugen ihren Teil zum Erfolg bei. Nach einer weiteren Station beim Zweitligisten Dinamo Bryansk, wechselte er 2012 nach Moskau zum FK Khimki.

Erfolgreich verlief diese Zeit jedoch nicht unbedingt. Der Stürmer kam in der First Division lediglich auf neun Einsätzen, in denen er immerhin zweimal traf. Der FK Khimki stieg nach dieser Spielzeit als Tabellenvorletzter in die drittklassige russische Professional Football League ab und Kalimullin wechselte zurück zu seinem Heimatverein KamAZ Naberezhnye Chelny.